Matheus Pereira chegou na Toca da Raposa em julho de 2023.  O jogador se machucou no começo de sua passagem pelo Cruzeiro. A lesão no joelho aconteceu durante a partida contra o Botafogo na última partida do 1º turno do Campeonato Brasileiro. 

O camisa 10 ficou mais de dois meses machucado. Após se recuperar, Matheus Pereira participou da reabilitação da Raposa no Brasileirão, ajudando assim o Cruzeiro a permanecer na Série A. 

Nas últimas 7 partidas com a camisa celeste (3 jogos pelo Campeonato Mineiro e duas pelo Brasileirão de 2023), Pereira marcou um gol, concedeu duas assistências, teve quatro grandes chances criadas, acertou 77% de seus dribles e recuperou 23 bolas. Os dados são do Softcore.

O jogador está emprestado ao Cruzeiro até o final de junho deste ano. Matheus Pereira pertence ao Al Hilal, da Arábia Saudita. Caso a equipe celeste deseje comprar o jogador, o clube saudita estipulou o valor de R$ 60 milhões de compra, para que Matheus Pereira assine em definitivo com a Raposa.